BLOSUM 80


Biochemical properties of the amino acids
C
  sulfhydryl
S, T, P, A ,G
  small, hydrophyllic
N, D, E, Q
  large, acidic and hydrophyllic
H, K, R
   basic
M, I, L, V
   small, hydrophobic
F, Y, W
  aromatic

  C S T P A G N D E Q H R K M I L V F Y W
C

9

                                      
S

-2

5

                                    
T

-1

1

5

                                  
P

-4

-1

-2

8

                                
A

-1

1

0

-1

5

                              
G

-4

-1

-2

-3

0

6

                            
N

-3

0

0

-3

-2

-1

6

                          
D

-4

-1

-1

-2

-2

-2

1

6

                        
E

-5

0

-1

-2

-1

-3

-1

1

6

                      
Q

-4

0

-1

-2

-1

-2

0

-1

2

6

                    
H

-4

-1

-2

-3

-2

-3

0

-2

0

1

8

                  
R

-4

-1

-1

-2

-2

-3

-1

-2

-1

1

0

6

                
K

-4

-1

-1

-1

-1

-2

0

-1

1

1

-1

2

5

              
M

-2

-2

-1

-3

-1

-4

-3

-4

-2

0

-2

-2

-2

6

            
I

-2

-3

-1

-4

-2

-5

-4

-4

-4

-3

-4

-3

-3

1

5

          
L

-2

-3

-2

-3

-2

-4

-4

-5

-4

-3

-3

-3

-3

2

1

4

        
V

-1

-2

0

-3

0

-4

-4

-4

-3

-3

-4

-3

-3

1

3

1

4

      
F

-3

-3

-2

-4

-3

-4

-4

-4

-4

-4

-2

-4

-4

0

-1

0

-1

6

    
Y

-3

-2

-2

-4

-2

-4

-3

-4

-3

-2

2

-3

-3

-2

-2

-2

-2

3

7

 
W

-3

-4

-4

-5

-3

-4

-4

-6

-4

-3

-3

-4

-4

-2

-3

-2

-3

0

2

11
  C S T P A G N D E Q H R K M I L V F Y W

Biochemical properties of the amino acids
C
  sulfhydryl
S, T, P, A ,G
  small, hydrophyllic
N, D, E, Q
  large, acidic and hydrophyllic
H, K, R
   basic
M, I, L, V
   small, hydrophobic
F, Y, W
  aromatic

Last modified: November 19th, 2010.
Maintained by Dannie Durand (durand@cs.cmu.edu) and Annette McLeod.